В геноме многоклеточных организмов присутствует множество сегментов ДНК, которые гибридизуются с U1-, U2-, U3-, U4-, U5-, U6 - и Ш-мяРНК или с соответствующими кДНК. Одни такие сегменты диспергированы, а другие сгруппированы (обычно в тандемные повторы). Как и в случае генов 5S-pPHK, соответствующий кодирующий участок может входить в состав длинного сегмента ДНК, который образует повторяющуюся единицу. Как правило (хотя и не всегда), функциональные гены организованы в кластеры, а псевдогены диспергированы. Кодирующие последовательности функциональных генов комплементарны последовательностям соответствующих мяРНК. Функциональные гены данной мяРНК обычно имеют сходные последовательности, фланкирующие кодирующий участок и содержащие регуляторы транскрипции. У псевдогенов, которые образовались из мяРНК в результате крупных делеций, вставок или точковых мутаций, фланкирующие последовательности в значительной степени различаются. Характер расположения и число генов и псевдогенов варьируют от одной мяРНК к другой и от вида к виду. Гены не столь многочисленных мяРНК, например Ull-мяРНК, пока не исследованы. Заметим, что у дрожжей имеется только по одной копии гена каждой из таких мяРНК и ни одного псевдогена. Как у дрожжей, так и у многоклеточных эукариот мяРНК участвуют в процессинге первичных транскриптов и в образовании функциональных РНК. В качестве примера, иллюстрирующего сложную организацию семейств рассматриваемых последовательностей, можно привести U1 - семейство ДНК человека. Оно содержит примерно 30 копий мяРНК - генов, организованных в тандемные повторы, и находится на коротком плече хромосомы. Каждый функциональный ген в повторе входит в состав повторяющейся единицы длиной не менее 44 т. п. н. Псевдогены располагаются в различных локусах генома и встречаются в 10 раз чаще, чем соответствующие гены.