Большая часть генов многоклеточных организмов эукариот экспрессируется только на определенных стадиях развития или только в определенных тканях. Это означает, что клетки должны располагать эффективными средствами подавления транскрипции всех генов, кроме тех, которые функционируют в клетках данного вида. Репрессия больших групп генов в принципе может осуществляться путем ограничения доступности необходимых факторов транскрипции, но, по-видимому, такой механизм маловероятен. Об этом свидетельствует тот факт, что гены, обычно не экспрессирующиеся в клетках определенного типа, могут экспрессироваться при введении их в клетки путем трансфекции. Например, гены глобина после трансфекции в фибробласты экспрессируются в 1000 раз эффективнее, чем эндогенные глобиновые гены в составе хромосом; более того, это различие сохраняется при последовательных клеточных делениях даже несмотря на то, что трансфицированные гены встраиваются в хромосомы. Как правило (хотя и не всегда), активность транскрипции генов, переданных путем трансфекции, бывает на порядок выше, чем у соответствующих эндогенных генов. Этот феномен объясняют тем, что репрессия происходит в результате изоляции молчащих генов в хрома - тиновых структурах более высокого порядка, из-за чего они становятся недоступными для комплексов транскрипции. Поскольку мы не располагаем детальной информацией о таких высокоупорядоченных хроматиновых структурах, мы не можем описать процесс перехода репрессированного хроматина в экспрес - сирующийся. Один из подходов к решению этой проблемы мог бы состоять в установлении корреляции между периодом клеточного цикла, когда происходит репликация конкретного гена, и его способностью участвовать в транскрипции. Вездесущие гены «домашнего хозяйства», экспрессирующиеся во всех тканях (например, гены дигидрофо - латредуктазы, цитоплазматического актина и глюкозо-6-фосфат-дегидрогеназы) реплицируются в первой половине S-фазы, а неэкспрессируемые гены, как правило, реплицируются позднее. Более того, гены имеют тенденцию к ранней репликации в тех тканях, где они экспрессируются, и к поздней-в тех тканях, где они молчат. Аналогичным образом, у млекопитающих неактивная Х-хромосома реплицируется позже, чем транскрипционно активная. Такая закономерность говорит о том, что при ранней репликации во время S-фазы ДНК, вероятно, переходит в состояние, в котором она более доступна для комплекса транскрипции или способна к более эффективному связыванию важных факторов транскрипции.