ДНК может иметь как правоспиральную, так и левоспи - ральную (Z) конформацию. Соотношение между этими двумя формами зависит от нуклеотидной последовательности ДНК и степени ее сверхспиральности, а также от ионной силы раствора, температуры и содержания ионов металлов. При определенных условиях право - и лево - спиральные участки могут чередоваться, а последовательности в местах сочленений или рядом с этими местами - обладать необычными свойствами субстратов для различных ферментов. Образование Z-ДНК in vitro было подтверждено при помощи нескольких физических методов, но существование такой структуры in vivo до недавнего времени подвергалось сомнению. Теперь эти формы обнаружены как в про-, так и в эукариотических генах. Как и ожидалось, содержание Z-ДНК in vivo сильно зависит от степени сверхспиральности ДНК. Ее образование облегчается также в тех участках, где пурины и пиримидины чередуются. Таковы, например, повторы d(CA)n • d(GT)n в середине молекул. Образованию Z-формы способствует и метилирование остатков С в местах чередования С и G (т. е. 5′-CGCGCG-3′). Имеются гакже данные о том, что последовательности, способные принимать Z-конформацию. соответствуют сайтам гиперчувствительности к нуклеазе, находящимся в области регуляции транскрипции некоторых генов. Идентифицированы и очищены белки, специфичные для Z-ДНК. Например, некоторые из этих белков связываются с энхансером промотора ранней области генома SV40. И все же, несмотря на существование Z-ДНК-сегментов в области регуляции транскрипции или по соседству с ней и белков, узнающих Z-ДНК, вопрос об участии этой формы ДНК в регуляции транскрипции пока остается открытым. Известно об одном случае участия белка, связывающего Z-ДНК, в рекомбинации ДНК, но и здесь конкретный механизм влияния ДНК-связывающего белка и конформации на рекомбинацию остается неясным.